Jakub Badełek

Jakub Badełek Student, Szkoła
Główna Gospodarstwa
Wiejskiego w
Warszawie

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Witam,
Poszukuję informacji na temat wykonania analizy post hoc w teście Kruskal Wallis. Posiadam zestaw danych o rozkładzie innym niż normalny. Kruskal-Wallis puszczony dla wszystkich group danych wykazuje mi, że grupy się różnią, niestety nie ma informacji które grupy się między sobą różnią a które nie. W ANOVie uzyskać takie info to banał - wystarczy postawić ptaszka w odpowiednim miejscu. Z niewiadomych dla mnie przyczyn w Kruskal Wallis tego się nie da zrobić, chyba że ja o czymś nie wiem. Ktoś ma jakiś pomysł? :)

Ubiegnę pewne odpowiedzi. W necie znalazłem takie rozwiązanie problemu:
http://privatewww.essex.ac.uk/~scholp/kw_posthoc.htm ( dla mnie przypadek kiedy grupy mają równą liczebność )

Oraz takie:
http://ptjournal.apta.org/content/77/12/1755.full.pdf ( tebalka nr 5 ) - to wyrasta nieco poza moje, ograniczone, umiejętność statystyczne...

Które rozwiązanie jest słuszne, a może to jedno i to samo ale w inny sposób? znacie może prostszy sposób? ;)

Dzięki za pomoc!

konto usunięte

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Elo.

W przypadku testów nieparametrycznych nie ma analiz post hoc.
Jeśli chcesz sprawdzić gdzie są różnice musisz porównywac wszystkie pary zmiennych ze sobą testem U Manna Whitneya.
Poza tym jeśli masz do czynienia z rozkładem nie normalnym , a Twoje grupy są duże (pow 20 poz) i równoliczne to spróbuj zrobić ANOVE.

pzdr.

P.S. jeśli będziesz porównywał wszystkie pary zmiennych , to musisz zrobić poprawkę na wielokrotne porównania. Wartość p dzielisz na ilość par porównań np. zrobiłes 3 porównania par 5/3= ok 0.167 (to jest coś ala poprawka Bonferroniego)
Rafał Piszczek

Rafał Piszczek Prezes zarządu w
spółkach BioStat®,
DM Soft/MedFile

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Konrad Hryniewicz:
Elo.

W przypadku testów nieparametrycznych nie ma analiz post hoc.
Jeśli chcesz sprawdzić gdzie są różnice musisz porównywac wszystkie pary zmiennych ze sobą testem U Manna Whitneya.
Poza tym jeśli masz do czynienia z rozkładem nie normalnym , a Twoje grupy są duże (pow 20 poz) i równoliczne to spróbuj zrobić ANOVE.

pzdr.

P.S. jeśli będziesz porównywał wszystkie pary zmiennych , to musisz zrobić poprawkę na wielokrotne porównania. Wartość p dzielisz na ilość par porównań np. zrobiłes 3 porównania par 5/3= ok 0.167 (to jest coś ala poprawka Bonferroniego)

No nie wiem czy to dobra rada, że ich nie ma i trzeba robić U Mann Whitney.
RP

konto usunięte

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

.Konrad Hryniewicz edytował(a) ten post dnia 02.05.11 o godzinie 21:55

konto usunięte

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Rafał Piszczek:
Konrad Hryniewicz:
Elo.

W przypadku testów nieparametrycznych nie ma analiz post hoc.
Jeśli chcesz sprawdzić gdzie są różnice musisz porównywac wszystkie pary zmiennych ze sobą testem U Manna Whitneya.
Poza tym jeśli masz do czynienia z rozkładem nie normalnym , a Twoje grupy są duże (pow 20 poz) i równoliczne to spróbuj zrobić ANOVE.

pzdr.

P.S. jeśli będziesz porównywał wszystkie pary zmiennych , to musisz zrobić poprawkę na wielokrotne porównania. Wartość p dzielisz na ilość par porównań np. zrobiłes 3 porównania par 5/3= ok 0.167 (to jest coś ala poprawka Bonferroniego)

No nie wiem czy to dobra rada, że ich nie ma i trzeba robić U Mann Whitney.
RP
a są ? :)
Jakub Badełek

Jakub Badełek Student, Szkoła
Główna Gospodarstwa
Wiejskiego w
Warszawie

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

No nie wiem czy to dobra rada, że ich nie ma i trzeba robić U Mann Whitney.
RP
a są ? :)

No własnie nie ma ;) pytanie: czemu? to chyba nic szczególnego i dość typowa, podstawowa sprawa - w anovie to normalka, czemu w nieparametrycznych trzeba wszystko na piechotę liczyć? aż mnie to dziwi.

Co do Mann Whitney'a - to co piszesz zgadza się z linkiem który podałem, jednak to ma się tyczyć przypadku kiedy grupy mają różną liczebność. Moje mają równą, ciekawi mnie jednak poprawność tej tabelki ( dla przypomnienia: http://privatewww.essex.ac.uk/~scholp/kw_posthoc.htm ). Może po prostu dla ciekawości policzę wszystko tę drugą metodą i sprawdzę na ile wyniki się różnią. Excel przychodzi z pomocą... tylko czemu mam to liczyć w excelu mając do dyspozycji taki soft?

konto usunięte

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Licho wie , może kolejna 19 wersja będzie miała opcję porównań parami.
Bądź ,co bądź interesuje mnie odpowiedź na to experta z biostatu .
Jakub Badełek

Jakub Badełek Student, Szkoła
Główna Gospodarstwa
Wiejskiego w
Warszawie

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Konrad Hryniewicz:
Licho wie , może kolejna 19 wersja będzie miała opcję porównań parami.

No ja innej możliwości nie widzę, bo trochę się naklepałem w Excelu, a co do dopiero mówić o sytuacji gdzie miałoby być kilkaset porównań. Alę wątpię w to. Z jakiejś przyczyny żaden program tego nie oferuje, znalazłem na różnych forach sytuacje gdzie ludzie mieli podobny problem i nigdzie nie było odpowiedzi. W R można sobie kod do tego napisać jak ktoś umie, ale na razie R to nie na moją głowę.
Bądź ,co bądź interesuje mnie odpowiedź na to experta z biostatu .

Ja również :)

konto usunięte

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Cześć,

według mnie (pozwolę sobie po imieniu) Konrad ma rację pisząc - Jeśli chcesz sprawdzić gdzie są różnice musisz porównywac wszystkie pary zmiennych ze sobą testem U Manna Whitneya.
Należy przy tym zwrócić uwagę na multiple comparisons (po niemiecku nazywanym α-Inflation) gdyż uproszcając z każdym nowym testem rośnie prawdopodobieństwo popełnienia błędu 1 rodzaju. SPSS od wersji 18 pozwala automatycznie dopasować "statistical significance" do ilości testów.

Także Post Scriptum jest w mojej ocenie super radą (przypomnieniem)
Wartość p dzielisz na ilość par porównań np. zrobiłes 3 porównania par 5/3= ok 0.167 (to jest coś ala poprawka Bonferroniego) - Choć ja bym napisał bez "ala" :)
Jakub Badełek

Jakub Badełek Student, Szkoła
Główna Gospodarstwa
Wiejskiego w
Warszawie

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Powiem tak... trzeba sobie odpuścić SPSS ;) byłem u swojego promotora i w 5 minut ( nie licząc ok "godzinnej" instalacji ) zrobiliśmy Kruskal-Wallis z bardzo przyjemnym choć prostym zestawieniem post-hoc - wszystko w R. Trzeba było tylko wiedzieć jakie biblioteki zainstalować ( Agricolae: http://cran.r-project.org/web/packages/agricolae/index... ) i mieć skrypcik ( kilka bajtów... ) i wsio... chwila roboty. Zaczynam się przekonywać o R :]Jakub Badełek edytował(a) ten post dnia 04.05.11 o godzinie 18:57

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

W R można pisać z poziomu samego SPSS. Możesz sobie nawet napisać w R "lepszego" Kruskalla-Wallisa z własnym oknem dialogowym, prezentującego wyniki w outpucie SPSS i "wciągającego" do swojego data.frame dane z SPSS. Polecam : )

konto usunięte

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Ten post powinien się nazywać złote rady !!! :D
Agata Kudlik

Agata Kudlik psycholog,
psychoterapeuta

Temat: Post hoc w Kruskal Wallis

Witam,
W PASW 18 jest test porównań parami dla nieparametrycznego testu Kruskala Wallisa. To test Dunna, który pokazuje nam które pary różnią się istotnie. W widoku trzeba po prostu kliknąć na "Porównania parami" (na samym dole w pasku narzędzi). Niestety nie mogę przesłać print screena - chyba się nie da tu przesyłać plików.

Następna dyskusja:

Dwuczynnikowa analiza waria...




Wyślij zaproszenie do